Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CluhQ5SW19 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms