Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ggnbp2Q5SV77 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms