Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc42Q5SV66 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms