Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bbs12Q5SUD9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms