Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znrf3Q5SSZ7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znrf3Q5SSZ7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znrf3Q5SSZ7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znrf3Q5SSZ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znrf3Q5SSZ7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.4 ms