Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam46cQ5SSF7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms