Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms