Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms