Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms