Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nsrp1Q5NCR9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms