Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rapgef6Q5NCJ1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
Rapgef6Q5NCJ1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms