Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm12253Q5NC48 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm12253Q5NC48 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm12253Q5NC48 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm12253Q5NC48 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm12253Q5NC48 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm12253Q5NC48 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm12253Q5NC48 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm12253Q5NC48 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm12253Q5NC48 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm12253Q5NC48 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm12253Q5NC48 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm12253Q5NC48 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm12253Q5NC48 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm12253Q5NC48 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm12253Q5NC48 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm12253Q5NC48 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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