Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ecm2Q5FW85 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms