Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm3Q5F4S9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms