Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1lQ5D525 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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