Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eme2Q56A04 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eme2Q56A04 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms