Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prune2Q52KR3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Prune2Q52KR3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms