Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBE8

Wdr18, WD repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr18Q4VBE8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr18Q4VBE8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr18Q4VBE8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr18Q4VBE8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr18Q4VBE8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr18Q4VBE8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr18Q4VBE8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr18Q4VBE8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr18Q4VBE8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr18Q4VBE8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr18Q4VBE8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr18Q4VBE8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr18Q4VBE8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms