Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trappc3lQ4KL14 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms