Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Shank3Q4ACU6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shank3Q4ACU6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms