Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap1-4Q3V2D6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap1-4Q3V2D6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms