Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms