Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M2

Lrrc36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc36Q3V0M2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc36Q3V0M2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc36Q3V0M2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc36Q3V0M2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc36Q3V0M2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc36Q3V0M2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc36Q3V0M2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc36Q3V0M2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc36Q3V0M2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc36Q3V0M2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc36Q3V0M2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc36Q3V0M2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc36Q3V0M2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc36Q3V0M2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms