Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc9Q3V038 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc9Q3V038 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms