Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrfip1Q3UZ39 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms