Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms