Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l2Q3UXB0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms