Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trat1Q3UU67 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trat1Q3UU67 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trat1Q3UU67 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trat1Q3UU67 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trat1Q3UU67 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trat1Q3UU67 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trat1Q3UU67 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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