Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc38a11Q3USY0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms