Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Klhdc9Q3USL1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms