Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SbsponQ3UPR9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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