Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms