Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrch2Q3UMG5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrch2Q3UMG5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrch2Q3UMG5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms