Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms