Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b2Q3UJB0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms