Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cnep1r1Q3UJ81 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnep1r1Q3UJ81 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms