Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx27Q3UHD6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx27Q3UHD6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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