Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB1

Nt5dc3, 5'-nucleotidase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nt5dc3Q3UHB1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nt5dc3Q3UHB1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nt5dc3Q3UHB1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms