Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mcrip1Q3UGS4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcrip1Q3UGS4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms