Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc58Q3UGP9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc58Q3UGP9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.9 ms