Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp36Q3UFY0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp36Q3UFY0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms