Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zyg11bQ3UFS0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms