Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Carmil3Q3UFQ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Carmil3Q3UFQ8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms