Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nom1Q3UFM5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nom1Q3UFM5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nom1Q3UFM5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nom1Q3UFM5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nom1Q3UFM5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nom1Q3UFM5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nom1Q3UFM5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nom1Q3UFM5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nom1Q3UFM5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nom1Q3UFM5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nom1Q3UFM5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nom1Q3UFM5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Nom1Q3UFM5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nom1Q3UFM5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nom1Q3UFM5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nom1Q3UFM5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms