Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc10a4Q3UEZ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc10a4Q3UEZ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms