Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttll12Q3UDE2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttll12Q3UDE2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttll12Q3UDE2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms