Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem109Q3UBX0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms