Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U6N9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U6N9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U6N9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q3U6N9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U6N9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U6N9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U6N9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U6N9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q3U6N9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q3U6N9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms