Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
YrdcQ3U5F4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
YrdcQ3U5F4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms