Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms